Монастырь Абхаягирия занимает площадь около 235 гектаров. Из хроник Махавамса известно, что монастырь был построен в I веке до нашей эры королем Валагамбаху (Vattagamini Abhaya) в период его второго правления (89 - 77 гг.). Валагамбаху стал королем в 103 году до нашей эры, но был низложен через 5 месяцев интервентами из Индии. Вторично он взошел на престол в 89 году и правил в течение 12 лет.

Монастырь был построен для группы монахов, изгнанных за ересь из монастыря Махавихара (Анурадхапура), создавших новое течение буддизма Махаяна (более либеральное направление буддизма, не отрицающее богов). Вскоре известность учения и монастыря распространились далеко за пределы Ланки, включая Индию, Китай и Индонезию, привлекая ученых со всего мира. К сожалению, монастырские записи не сохранились, а хроники Махавамса, писавшиеся в монастыре Махавихара, не уделили большего внимания конкурирующей секте, поэтому история северного монастыря большей частью неизвестна. Фа-Хсиен, китайский странствующий буддийский монах, живший в монастыре в V веке нашей эры, утверждал, что население монастыря в то время составляло 5000 человек.

Главная достопримечательность комплекса Абхаягири дагоба была построена королем Гаджабаху (114 - 136 гг.) и считалась второй по величине ступой (115 м) в мире, лишь немногим уступала ступе Джетаванарама (120 м). Ступа построена над отпечатком ступни Будды и является одним из 8 святых мест Анурадхапуры. Сейчас размеры ступы не превышают 79 метров в высоту и 106,5 м в диаметре.

Кроме главной ступы на территории монастыря есть небольшие, но не менее важные ступы. Ланкарама - одна из них, была построена королем Валагамбаху, и какое-то время служила ему убежищем во время оккупации Анурадхапуры тамильскими завоевателями.

Самый большой зал для ансамблей, найденный на Шри-Ланке, Саннипатасала, расположен напротив южного входа главной ступы. Открытый зал без кровли, построенный из камня, имеет четыре входа.

Восстановлено несколько монашеских келий монастыря, сгруппированных по 5 штук (Панкаваса). Комната в центре и 4 комнаты по углам отгорожены стеной. Центральная комната здания, где находилась библиотека, была предназначена для учителя и использовалось в качестве классной комнаты. В угловых комнатах жили монахи-ученики, по 3 монаха в комнате. Таким образом, каждый комплекс был занят 24 учениками и одним учителем. Кирпичные стены были покрыты штукатуркой, а крыша выложена из глянцевой керамической плитки, черепки которой обнаружены при раскопках. Жилые помещения снабжались горячей и холодной водой, а так же туалетами с уникальной дренажной системой.

В трапезной монастыря обнаружен каменный котел, вмещающий, как показали измерительные испытания, 5000 плошек риса. Вероятно, в нем хранили рис. Это подтверждает заявление Фа-Хсиена, что 5000 монахов проживало в монастыре.

Восстановлен большой бассейн Эт Покуна, размером равный шести современным олимпийским бассейнам и снабжавший водой большую часть комплекса.

Другое уникальное с артистической и технической точек зрения сооружение монастыря - Бассейны Близнецы, восстановленные раньше. На самом деле бассейны нельзя считать близнецами потому, что один бассейн на 12 м больше другого. Уникальность бассейнов состоит в системе очистки воды: вода проходит через ряд небольших углублений, в которых грязь оседает на дно, а чистая вода поступает в бассейны.